12 DNA i RNA meta + 6 bio-inspiriranih derivata lignana =1 rad (diplomski +znanstveni (Wos Q1))
Glavni istraživač
Prepoznavanje specifičnih sekvenci nukleinskih kiselina pomoću malih molekula predmet je velikog broja istraživanja. Interes za takvim istraživanjima proizlazi iz činjenice da je ekspresija gena u svim živim organizmima kontrolirana regulatornim proteinima koji se vežu na specifične sekvence na jednolančanim ili dvolančanim nukleinskim kiselinama. Osim u terapijama protiv raka, male molekule koje emitiraju specifične ili barem visoko selektivne signale nakon vezanja na određene DNA i RNA sekvence važne su za mnoge tehnologije koje se koriste u molekularnoj biologiji i medicini
Posljednjih godina u otkrivanju novih lijekova obnovljen je interes za prirodnim bioaktivnim spojevima ili bioaktivnim spojevima sintetiziranih na temelju vodeće (eng.hit) strukture prirodnog spoja. Neki od tih spojeva odnose se na strukturno vrlo raznoliku skupinu, lignane i njima srodne strukture. Najpoznatiji među njima je podofilotoksin čijom optimizacijom su dobiveni antitumorski lijekovi etopozid, etopofos i tenipozid.
S obzirom na slabu zastupljenost u prirodi (dosad poznato samo pet prirodnih benzoksantenskih lignana), ali i malih iskorištenja dobivenih prilikom malobrojnih pokušaja sinteze derivata, biološka svojstva i moguće farmakološke primjene benzoksantenskih lignana gotovo su neistraženi.
Ciljevi predloženog projekta su:
1) detaljno karakterizirati interakciju vezanja lignanskih derivata s DNA i RNA metama u bioanalitičkom sustavu i utvrditi utjecaj svojstava nastavaka na C1 i C2 atomima benzoksantenskog prstena na vezanje na dvolančane i jednolančane DNA i RNA
2) izabrati spoj ili spojeve koji će specifično/selektivno (npr. visoki afinitet vezanja ili specifični spektroskopski odgovor) prepoznati sekundarnu konformaciju i/ili sekvencu polinukleotida
3) istražiti moguću povezanost između veznog potencijala odabranih spojeva i antiproliferativne aktivnosti u staničnoj kulturi (in vitro sustav)
4) obrazovati mladog istraživača (diplomanda)
5) objaviti rad u časopisu citiranom u Wos bazi ranga Q1.