Prijeđite na glavni sadržaj

Genomika i epigenomika holocentromera u nematoda Meloidogyne

Tip projekta
u tijeku
Program
Istraživački projekti
Financijer
Hrvatska zaklada za znanost
Datum početka
20.12.2024.
Datum završetka
19.12.2027.
Status
Aktivan
Iznos financiranja
199525 EUR
Više informacija

Centromera je kompleksni kromosomski lokus koji ima jednu od najvažnijih uloga u procesu segregacije kromosoma. Abnormalnosti u ovoj regiji uzrokuju brojne poremećaje poput stanične smrti, aneuploidije, neplodnosti i raka. Iako centromere imaju očuvanu funkciju, histon H3 specifičan za centromere (CenH3) i centromerna DNA brzo se mijenjaju. Dok većina eukariota ima jednu regionalnu centromeru, neke biljne i životinjske vrste imaju holocentromere raspoređene na više mjesta duž kromosoma. Organizacija genoma i sastav kromatina holocentričnih kromosoma slabo su poznati. Naši prethodni rezultati upućuju na jedinstvenu organizaciju holocentromera u formi klastera i dupliciranje CenH3 gena specifičnog za centromere u mitotičkim i mejotičkim nematodama roda Meloidogyne. Prvi cilj ovog prijedloga je istražiti linearnu organizaciju, genomsku dinamiku i okolinu holocentromera u vrsti Meloidogyne incognita i njezinim srodnicima, korištenjem novih genomskih sklopova sekvenciranih dugim očitanjima. Pojavljivanje dva CenH3 paraloga u mejotičkim vrstama Meloidogyne ukazuje na mogućnost subfunkcionalizacije CenH3 paraloga. U tom smislu, drugi cilj ovog projekta je otkriti pretpostavljenu razliku između strukture holocentričnog CenH3 kromatina u mitozi i mejozi kod mejotičkih vrsta roda Meloidogyne. Moguća subspecijalizacija CenH3 za mitozu i mejozu kod vrsta Meloidogyne pruža jedinstvenu priliku za razumijevanje funkcija CenH3 u centromere. Osim istraživanja genomskih i epigenomskih karakteristika holocentromera, naša će studija također rasvijetliti moguće aspekate arhitekture i evolucije genoma koji su pod utjecajem organizacije ovih neobičnih centromera.

Ova stranica koristi kolačiće. Neki od tih kolačića nužni su za ispravno funkcioniranje stranice, dok se drugi koriste za praćenje korištenja stranice radi poboljšanja korisničkog iskustva. Za više informacija pogledajte naše uvjete korištenja.

Prilagodi postavke
  • Kolačići koji su nužni za ispravno funkcioniranje stranice. Moguće ih je onemogućiti u postavkama preglednika.