Molekularno prepoznavanje DNA:RNA hibridnih i višelančanih struktura u bioanalitičkim i in vitro sustavima
Glavni istraživač
DNA:RNA hibridne i višelančane strukture stvaraju se kao prijelazne strukture tijekom mnogih biološki važnih procesa ako što su replikacija DNA, transkripcija, replikacija telomera i virusa HIV. Stoga predstavljaju atraktivne mete za male molekule osobito zato što nema puno literaturnih izvora koji navode ligande sa selektivnim vezanjem na te mete. Za ispunjavanje glavnog cilja projekta, potraga za novim strukturnim motivima/spojevima sa preferencijalnim vezanjem na DNA:RNA hibridne i višelančane strukture u odnosu na regularne DNA i RNA dvolančane i jednolančane strukture, prvo moraju biti ispunjeni drugi ciljevi: formiranje biblioteke spojeva sa strukturnim motivom potrebnim za prepoznavanje ovih meta, uvođenje i primjena novih DNA i RNA meta (DNA:RNA hibridne i višelančane strukture) i metoda visoke propusnosti (kompeticijska dijaliza, temperaturno mekšanje smjesa, RNaseH test) u područje istraživanja projektnog tima, koje bi omogućile brzi probir spojeva sa sposobnošću prepoznavanja tih meta. Slijedeći cilj je detaljno istražiti način vezanja izabranih kompleksa ligand-DNA/RNA u bioanalitičkim sustavima (vodene puferirane otopine) pomoću spektroskopskih, kalorimetrijskih i komputacijskih metoda. Istražiti ćemo također moguću korelaciju između visokog veznog potencijala izabranih spojeva i antiproliferativne aktivnosti u kulturi stanica (MTT, protočna citometrija, konfokalna mikroskopija). Očekivani rezultati, ispunjavanje gore navedenih ciljeva, mogu se iskoristiti za: proširivanje osnovnog znanja u ovom području istraživanja, optimizaciju strukture spojeva s ciljem poboljšavanja njihove selektivnosti vezanja prema željenim DNA i RNA metama, moguću medicinsku primjenu, jačanje međuinstitucijske suradnje u Hrvatskoj i razvoj novih znanstvenih ekspertiza što će nama i našim suradnicima omogućiti publiciranje u časopisima visoke kvalitete.