Prijeđite na glavni sadržaj

Obogaćivanje hrvatskog istraživačkog sustava metodologijom za analizu ekspresije RNA s 5'-GTP-kapom kao antitumorskih meta (CroAGE)

Tip projekta
Znanstveno-istraživački projekti
Program
Mehanizam za oporavak i otpornost
Financijer
Europska unija
Datum početka
1.7.2023.
Datum završetka
30.6.2026.
Status
Aktivan
Iznos financiranja
748061 EUR
Više informacija

Integrirajući raznolike stanične signale, promotori usklađuju ekspresiju, tj. transkripciju gena. Kao takve, ove genske regije ključne su za pravilan razvoj i zdravlje organizama, kao što su i njihove mutirane inačice presudne za rast i širenje tumora. Međutim, detalje arhitekture promotora, kao i načine na koji ih tumori prekrajaju, moguće je ispitati samo primjenom novih genomičkih strategija, jedna od kojih je u hrvatskom istraživačkom prostoru za sada neimplementirana tehnologija za analizu ekspresije RNA s 5'-GTP-kapom (engl. cap analysis of gene expression, CAGE). Ova metoda, danas primjenjivana samo u nekolicini vrhunskih istraživačkih skupina u svijetu, identificira pojedinačni nukleotid na kojem započinje transkripcija, čime nenadmašno rasvjetljava dinamiku rada promotora. Surađujući s uglednim zapadnoeuropskim istraživačkim grupama, u ovom ćemo projektu utemeljiti hrvatsku istraživačku skupinu koja provodi CAGE metodu te primjenom strojnog učenja razviti nove genomičke algoritme za obradu dobivenih podataka. Primjenom ove metode na uzorcima riba i vodozemaca, npr. uzorcima ribe zebrice, zapadne pandžaste žabe i aksolotla, te njihovom usporedbom s dostupnim podacima za sisavce i ljudske tumore, razotkrit ćemo sveobuhvatna pravila evolucije promotora kralježnjaka i obrasce kojim ih tumori iskrivljuju, a time i nove antitumorske mete. Konačno, provođenjem analize tržišta i studije izvedivosti, razmotrit ćemo tržišnu spremnost novouspostavljenih resursa.

Ova stranica koristi kolačiće. Neki od tih kolačića nužni su za ispravno funkcioniranje stranice, dok se drugi koriste za praćenje korištenja stranice radi poboljšanja korisničkog iskustva. Za više informacija pogledajte naše uvjete korištenja.

Prilagodi postavke
  • Kolačići koji su nužni za ispravno funkcioniranje stranice. Moguće ih je onemogućiti u postavkama preglednika.