Kalanoidni kopepodi i pelagički tunikati su dvije najbrojnije skupine mezozooplanktona sa najvećim utjecajem na pelagičke ekosustave. Te dvije skupine imaju najveći utjecaj na fitoplankton kroz predaciju kojom utječu na tijek i jačinu cvjetanja fitoplanktona. Osim toga su i glavni sekundarni proizvođači te važni izvor hrane višim trofičkim razinama. Genetička raznolikost ovih dviju skupina se nije do sada istraživala u južnom Jadranu, a za planktonske tunikate je jako malo podataka i na svjetskoj razini. Da bismo sveobuhvatno istražili genetičku raznolikost ovih skupina u Jadranu koristit ćemo metodu metabarkodiranja. Metabarkodiranje je revolucionarna metoda za procjenu biološke raznolikosti i određivanje sastava zajednica sekvenciranjem ortolognih sekvenca DNA gotovo svih vrsta unutar uzorka pomoću tehnika visokopropusnog paralelnog sekvenciranja (VPS). U tu svrhu izradit ćemo bazu podataka važnih gena za barkodiranje kao što su COI, 18S, kao i ITS regija za kalanoidne kopepode i pelagičke plaštenjake, koja će poslužiti kao referenca za buduće studije. Cilj našeg projekta je korištenje VPS tehnika za genetičku karakterizaciju populacija jadranskog mezozooplanktona, utvrđivanje razlika u njihovom genetičkom sastavu između različitih dijelova Jadrana, koji se razlikuju po dubini, razini sezonskih promjena u slanosti i temperaturi (kao što su sjeverni i južni Jadrana) i udaljenosti od obale. Posebna će se pažnja posvetiti genetičkoj karakterizaciji populacija dubokog mora kao i populacija u zatvorenim obalnim sustavima za koje je poznato da sadrže zooplanktonske populacije jedinstvenog genetičkog sastava, poput Mljetskih jezera. Projekt će prikupiti opsežne podatke o stanju i interakcijama jadranskih zooplanktonskih zajednica koji će poslužili kao osnova za bolje upravljanje okolišem. Nadalje, procijenit ćemo potencijal VPS-a kao tehnike praćenja alohtonih vrsta, njihovo širenje i utjecaj na zooplanktonske zajednice.