Razumijevanje (eko)toksikološke uloge odabranih SLC i MATE transportnih proteina zebrice (Danio rerio) korištenjem metoda funkcionalne genomike
Glavni istraživač
Polispecifični membranski transportni proteini predstavljaju integralni dio kompleksne stanične obrane u sisavaca, a dva tipa transportera pri tome su od osobite toksikološke važnosti: tzv. uptake transporteri i efflux transporteri. Analogni stanični obrambeni sustav uključen je u procesiranje endo- i ksenobiotika i u vodenih organizama. Nedavna istraživanja naše i drugih istraživačkih skupina pokazala su da procesiranje ksenobiotika u vodenih organizama uključuje regulaciju njihove apsorpcije putem SLC (solute carriers) uptake transportera organskih aniona i kationa, nakon čega slijedi njihova biotransformacija posredovana detoksikacijskim enzimima faze I. i II. Nastali metaboliti, a u nekim slučajevima i originalni spojevi, potom se aktivno izbacuju iz stanica posredstvom tzv. ABC (ATP binding cassette) transportera. Osim toga, pokazali smo i da je nedavno otkrivena grupa efflux transportera, tzv. MATE (multidrug and toxic compound extrusion) proteina, prisutna i aktivna u ribi zebrici (Danio rerio). Oslanjajući se naša nedavna istraživanja uptake i efflux transportera, u ovom projektu namjeravamo značajno unaprijediti naše razumijevanje (eko)toksikološke uloge odabranih SLC i MATE proteina koristeći se oruđima funkcionalne genomike zebrice. Ukratko, u projektu ćemo: (1) koristiti zebricu kao etabliran istraživački model kralješnjaka; (2) fokusirati se na uptake i efflux transportere nedavno karakterizirane in vitro (Oatp1d1, Oat1/3, Oct1, Mate7), s dodatkom transportera koji nisu bili analizirani u našim prijašnjim in vitro istraživanjima (Oatp2b1, Mates3 and 8); i (3) pokušat ćemo otkriti fiziološku i/ili obrambenu ulogu odabranih transportera korištenjem CRISPR/Cas9 pristupa editiranja genoma za stvaranje prvih genetički modificiranih zebrica za odabrane transportere, koje ćemo potom koristiti za određivanje posljedičnih promjena fenotipa, odnosno toksikološkog odgovora tijekom izlaganja modelnim supstratima i inhibitorima, uključujući okolišna zagađivala.