Prijeđite na glavni sadržaj

Satelitska DNA u genskoj regulaciji i ekološkoj adaptaciji

Glavni istraživač

Tip projekta
Znanstveno-istraživački projekti
Program
Istraživački projekti
Financijer
Hrvatska zaklada za znanost
Datum početka
1.9.2015.
Datum završetka
9.1.2019.
Status
Završen
Iznos financiranja
929000 HRK
Više informacija

Ponovljena DNA kao npr. transpozoni, može biti izvor regulatornih sekvenci te doprinijeti raspršenju regulatornih elemenata unutar eukariotskog genoma. Međutim, utjecaj na gensku regulaciju druge skupine vrlo zastupljenih, uzastopno ponovljenih sekvenci DNA kao što je satelitska DNA, nije do sada pokazan. U crvenom brašnaru Tribolium castaneum (Coleoptera) satelitska DNA igra važnu ulogu u regulaciji i remodeliranju heterokromatina tijekom razvoja i odgovora na vanjski stres. Ekspresija glavne satelitske DNA je jako potaknuta termičkim stresom, a povećana razina malih interferirajućih RNA (siRNA) koje potječu od satelitske DNA je praćena povećanjem represivnih epigenetskih modifikacija na histonima u heterokromatinu. Uz prisustvo u heterokromatinu, kratki odsječci satelitske DNA su raspršeni u blizini protein-kodirajućih gena u eukromatinu. Transkripcija glavne satelitske DNA osjetljiva na okolišne uvjete kao i njena raspršenost u susjedstvu gena upućuje na moguću ulogu satelitskih elemenata u regulaciji genske aktivnosti i adaptaciji na uvjete u okolišu.Cilj predloženog projekta je ispitati ulogu satelitske DNA u regulaciji aktivnosti gena u kukcu T. castaneum. Mi pretpostavljamo da siRNA koja potječe od satelitskih DNA utječe na epigenetski status dijelova eukromatina koji sadrže raspršene satelitske elemente na način da specifično navodi kromatinske modifikatore, primarno histonske metiltransferaze, na te regije. To može dovesti do nastanka heterokromatina na raspršenim satelitskim DNA elementima i njegovog širenja na susjedna područja. Takova „heterokromatizacija“ može utjecati na ekspresiju susjednih gena, vjerojatno smanjujući njihovu aktivnost. Očekujemo da će naši rezultati po prvi put pokazati ulogu satelitskih DNA u podešavanju genske ekspresije i u ekološkoj adaptaciji.

Ova stranica koristi kolačiće. Neki od tih kolačića nužni su za ispravno funkcioniranje stranice, dok se drugi koriste za praćenje korištenja stranice radi poboljšanja korisničkog iskustva. Za više informacija pogledajte naše uvjete korištenja.

Prilagodi postavke
  • Kolačići koji su nužni za ispravno funkcioniranje stranice. Moguće ih je onemogućiti u postavkama preglednika.