Traženje kandidata za nove lijekove protiv raka prostate korištenjem Vini in silico modela karcinoma
Glavni istraživač
Centar za informatiku i računarstvo IRB-a, kao nositelj podrške i suradnje akademske zajednice u primjeni HPC tehnologije i infrastrukture u sklopu EuroCC2 centra kompetencija, obznanjuje aktivnost u sklopu Vini eLab-a.
Rak vremenom može postati otporan na sve postojeće terapije uključujući i radijaciju. Zbog toga je važno primijeniti što učinkovitiju terapiju u ranoj fazi i uništiti stanice raka prije nego razviju otpornost. Pronalaženje novih lijekova za rak je izazovno zbog njegove ekstremne složenosti i brojnih mehanizama kojima se služi u svom nastanku, razvoju, i napredovanju. Međutim, pojavom snažnih računala i aplikacija koje mogu simulirati metaboličke procese bolesti postalo je moguće dešifrirati kompleksnost raka i time brže i učinkovitije pronalaziti kandidate za nove lijekove.
Slijedno, u okviru EuroHPC Regular Access poziva EHPC-REG-2022R03-224, tim znanstvenika Centra za informatiku sa Instituta Ruđer Bošković i onkologa KBC Sestre Milosrdnice, pod vodstvom Dr. Draška Tomića, koristi Vini aplikaciju za pronalaženje novih terapija protiv raka prostate. Vini za odabir kandidata za lijekove koristi metaboličke putanje bolesti i složeni matematički postupak koji jamči optimalno rješenje. Aplikacija se vrti na superračunalu HPC Vega – IZUM, Maribor, Slovenia, i za potrebe ovog istraživanja joj je dodijeljeno 10 milijuna jezgra sati.