Izgradnju ove baze podataka inicirali su znanstvenici kojima su bile potrebne informacije o topologiji i TM segmentima membranskih proteina. Ubrzo je postala baza podataka sposobna za pohranu bilo koje biomolekule koje se mogu naći na PDB.
Koristeći model relacijskih baza podataka, ova baza nam omogućava da lakše dođemo do bilo kojeg atoma podataka pohranjenih unutar baze te nam olakšava pretraživanje čiji onda rezultati mogu biti prikazani kao tekst za daljnju analizu ili u povray formatu za vizualizaciju Nakon izvoženja rezultata pretraživanja možemo poslati scene na mrežu i rednerirati komplekne vizualizacije te pohraniti ih u MPEG formatu koji će biti dostupan za skidanje kasnije. Ovaj projekt je samo početak izrade kompleksnih projekata za pohranu, potragu, vizualizaciju i analizu bilo kojeg drugog PDB strukture.

http://mamlaz.irb.hr/pdb_grafika/