Viroid vretenastoga gomolja krumpira (Potato spindle tuber viroid, PSTVd) je najvažniji subviralni patogen krumpira (Solanum tuberosum L.).

Zbog široke rasprostranjenosti u svijetu i patogenog učinka na mnoge poljoprivredne kulture, zaraza viroidom PSTVd može predstavljati ograničenje u proizvodnji hrane. Molekularni mehanizmi kojima viroidi induciraju kompleksne promjene u ekspresiji gena i metabolizmu biljaka domaćina nisu u potpunosti razjašnjeni. Novija saznanja ukazuju  da fitohormoni posreduju u regulaciji mnogih signalnih putova uključenih u interakciju biljaka i viroida.

Glavni cilj ove studije je analizirati dinamiku odgovora biljaka krumpira na infekciju viroidom PSTVd kako bi dobili uvid u fitohormonima-posredovane odgovore na infekciju i pojasnili ulogu fitohormona u razvoju simptoma. U ovoj studiji provesti ćemo sustavno istraživanje ekspresije gena i endogenih fitohormona kako bi bolje razumjeli fiziološko značenje promjena u statusu fitohormona tijekom napredovanja bolesti.

Doprinos jasmonske kiseline (JA) i salicilne kiseline (SA) u odgovoru na infekciju viroidom PSTVd  istražit ćemo koristeći transgenične linij e krumpira koje nemaju mogućnost nakupljanja JA i SA, kako bi utvrdili može li nedostatak fitohormona biti povezan sa sistemskim odgovorom i karakteristikama simptoma.

Analizu transkriptoma listova sistemski zaraženih ne-transgeničnih i transgeničnih linija krumpira provesti ćemo kako bi dobili detaljan uvid u diferencijalno eksprimirane gene uključene u signalne putove fitohormona i njihove interakcije.

Nadalje, promjene u ekspresiji tih gena biti će uspoređen s profilom ekspresije nekih konzerviranih miRNA s ciljem identificikacije miRNA uključenih u modulaciju signalnih putova fitohormona tijekom odgovora krumpira na zarazu viroidom PSTVd.

Nova saznnja mogu pridonijeti boljem razumijevanju kompleksnih interakcija biljaka i viroida te pomoći razvoj strategija za zaštitu biljaka od ovog patogena.

Suradnje

• Prof. dr. sc. Dunja Leljak Levanić (Prirodoslovno-matematički fakultet, Sveučilište u Zagrebu)
• Prof. dr. sc. Snježana Kereša (Agronomski fakultet, Sveučilište u Zagrebu)
• dr.sc. Jana Oklestkova (Laboratory of Growth Regulators, Faculty of Science, Palacký University in Olomouc, Czech Republic)
• Prof. dr. sc. Sabine Rosahl (Leibniz Institute of Plant Biochemistry, Halle (Saale), Germany)
• dr.sc. César Llave (Center for Biological Research, Madrid, Spain)