Nemo6 - Struktura, funkcija i evolucija proteina Nme6/Nm23-H6
Glavni istraživač
Nukleozid difosfatske kinaze (Nme/nm23/NDPK) čine obitelj evolucijski sačuvanih enzima ključnih za odvijanje brojnih važnih bioloških procesa. Njihova biokemijska funkcija još nije u potpunosti razjašnjena unatoč brojnim istraživanjima u posljednja dva desetljeća. Obitelj proteina Nme sastoji se od deset članova podijeljenih u dvije grupe. Grupa I, koja obuhvaća proteine Nme1-Nme4 dosad je intenzivno istraživana, posebno Nme1 u kontekstu stvaranja metastaza te Nme2 koji je vjerojatno uključen u bolesti srca. Članovi Grupe I kod čovjeka pokazuju međusobno visoki stupanj sličnosti kao i u usporedbi sa svojim ortolozima kod drugih Metazoa. Svi članovi Grupe I posjeduju aktivnost NDPK u obliku heksamera. Članovi Grupe II pokazuju međusobno niži stupanj homologije te ne posjeduju aktivnost NDPK, s mogućom iznimkom proteina Nme6. Njihova multimerna struktura još nije utvrđena. Članovi Grupe II pojavili su se ranije tijekom evolucije, pogotovo Nme5, Nme6 i Nme7. Brojnih proteini iz evolucijski različitih organizama pokazuju visoku sačuvanost ne samo u primarnoj strukturi već i u predviđenoj sekundarnoj i tercijarnoj strukturi s ortolozima kod sisavaca, uključujući i čovjeka. Stoga se može pretpostaviti da najvjerojatnije imaju slične ili identične biokemijske i biološke funkcije. Spužve se smatraju živim fosilima te se pretpostavlja da se struktura njihovog genoma i proteoma nije znatno promijenila u posljednjih 500 milijuna godina. Dakle, možemo pretpostaviti da spužve odražavaju sačuvanu strukturu genoma i proteoma kao kod zajedničkog pretka svih Metazoa. Naši rezultati na genima/proteinima Nme kod spužve pokazuju da NmeGpISd, jedini predstavnik Grupe I kod morske spužve Suberites domuncula, vjerojatno odražava karakteristike gena/proteina pretka cijele Grupe I, koji je postojao prije duplikacije ove grupe kod kralježnjaka i drugih evolucijskih grana. Nasuprot tome, rezultati naših istraživanja na genu/proteinu Nme6Sd kod spužve upućuju da vjerojatno ovaj spužvin protein ima različite stanične funkcije nego njegov ljudski homolog. Predloženi projekt oslanja se na naša prijašnja istraživanja obitelji Nme kod čovjeka i spužvi s ciljem rješavanja strukture, biokemijske i biološke funkcije te evolucije ljudskog Nme6. U tu svrhu koristit ćemo niz biokemijskih metoda u kombinaciji s najnovijim metodama u molekularnoj biologiji te naprednu konfokalnu mikroskopiju. Cilj nam je 1) razjasniti potencijalnu aktivnost NDPK i kvartarnu strukturu Nme6; 2) istražiti uključenost Nme6 u važne stanične fiziološke procese; 3) odrediti lokalizaciju Nme6; 4) odrediti moguće proteine s kojima Nme6 ulazi u interakcije, s naglaskom na proteine Grupe I te unutarstanični smještaj njihovih interakcija.Uvjereni smo da će naše istraživanje na Nme6 uvelike doprinijeti općem poznavanju obitelji gena/proteina te dati uvid u uloge njenih članova u glavnim bolestima današnjice.
Publikacije:
Znanstveni radovi:
1. Ćetković H, Harcet M, Roller M, Herak Bosnar M*. A survey of metastasis suppressors in Metazoa. Laboratory Investigation 2018, Laboratory Investigation 98, 554–570,2018
2. Herak Bosnar M*, Radić M, Ćetković H. A young researcher’s guide to NME/Nm23/NDP Kinase Periodicum biologorum 120, 3-9, 2018
3. Ćetković H+, Halasz M+, Herak Bosnar M+: Sponges: A Reservoir of Genes Implicated in Human Cancer. Marine Drugs, Marine Drugs , 16(1), 20, 2018
+equal contribution
4. Ćetković H, Herak Bosnar M, Perina D, Mikoč A, Deželjin M, Belužić R, Bilandžija H, Ruiz-Trillo I, Harcet M. Characterization of a group I Nme protein of Capsaspora owczarzaki—a close unicellular relative of animals, Laboratory Investigation 98, 304–314, 2018
5. Radić M, Šoštar M, Weber I, Ćetković H, Slade N, Herak Bosnar M*. The Subcellular Localization and Oligomerization Preferences of NME1/NME2 upon Radiation-Induced DNA Damage, Int J Mol Sci 21, 2363-2382, 2020
6. Proust B, Radić M, Škrobot Vidaček N, Cottet C, Attia S, Lamarche F, Ačkar L, Godinić Mikulčić V, Tokarska-Schlattner M, Ćetković H, Schlattner U, Herak Bosnar M*. NME6 is a phosphotransfer-inactive, monomeric NME/NDPK family member and functions in complexes at the interface of mitochondrial inner membrane and matrix. Cell Bioscience 11, 195, 2021
Sudjelovanja na skupovima:
1. 13th Multinational Congress on Microscopy, Rovinj, Hrvatska, 24. - 29.09.2017..
Helena Ćetković, Martina Radić, Lucija Ačkar, Maja Herak Bosnar.
Nucleoside-diphosphate kinase Nme6 in humans and sponges // 13th Multinational Congress on Microscopy, Rovinj, Hrvatska, 24. - 29.09.2017. 202-203 (poster).
2. EACR25 - 25TH BIENNIAL CONGRESS OF THE EUROPEAN ASSOCIATION FOR CANCER RESEARCH, Amsterdam, Nizozemska, 30. lipnja - 03. srpnja 2018.
Herak Bosnar, Maja; Radić, Martina; Ačkar, Lucija; Proust, Bastien Lucien Jean; Ćetković, Helena.
SUBCELLULAR LOCALIZATION AND EXPRESSION OF NME6, A MEMBER OF THE NME/NM23/NDPK FAMILY, IN HUMAN TUMOUR CELLS // ESMO Open - Abstracts of the 25th Biennial Congress of the European Association for Cancer Research, Amsterdam, The Netherlands, 30 June - 3 July 2018 / Berns, Anton (ur.).
London : European Society for Medical Oncology, 2018. (poster,međunarodna recenzija,sažetak,znanstveni).
3. FEBS3+-From molecules to living systems, Siofok, Mađarska, 02. - 05. rujna, 2018.
Proust, Bastien Lucien Jean; Radić, Martina; Ačkar, Lucija; Škrobot Vidaček, Nikolina; Ćetković, Helena; Herak Bosnar, Maja.
NME6 expression and subcellular localization in human tumor cell lines // FEBS3+ From molecules to living systems Final Programme & Book of Abstracts.
2018. (poster,međunarodna recenzija,sažetak,znanstveni).
4. FEBS3+-From molecules to living systems, Siofok, Mađarska, 02. - 05. rujna, 2018.
Herak Bosnar, Maja; Perina, Drago; Harcet, Matija; Mikoč, Andreja; Bago, Ružica; Deželjin, Martina; Ćetković, Helena.NME/NM23/NDPK from unicellular eukaryotes to humans // FEBS3+ From molecules to living systems Final Programme & Book of Abstracts.
2018. (pozvano predavanje)
5. HDIR-5; Translating Science to Medicine-Targets and Therapeutics. Fifth meeting of the Croatian Association for Cancer Research with International Participation, 08.-10. studenog, 2018.
PROUST, Bastien Lucien Jean; RADIĆ, Martina; ŠKROBOT VIDAČEK, Nikolina; AČKAR, Lucija; ĆETKOVIĆ, Helena; HERAK BOSNAR, Maja.
THE HUMAN NME6: EXPRESSION AND SUBCELLULAR LOCALIZATION IN TUMOR CELL LINES // HDIR-5 Meeting, Libri Oncologici, Croatian Journal of Oncology.
Zagreb : University Hospital for Tumors, Zagreb, Croatia, 2018. 1-93 (poster,međunarodna recenzija,sažetak).
6. 26. godišnji sastanak Hrvatskog mikroskopijskog društva
PROUST, Bastien Lucien Jean; RADIĆ, Martina; ŠKROBOT VIDAČEK, Nikolina; AČKAR, Lucija; ĆETKOVIĆ, Helena; HERAK BOSNAR, Maja.
THE HUMAN NME6: EXPRESSION AND SUBCELLULAR LOCALIZATION IN TUMOR CELL LINES (poster,međunarodna recenzija)
7. The 45th FEBS Virtual Congress, 03. – 08. srpanj 2021.
Proust, Bastien Lucien Jean; Škrobot Vidaček, Nikolina; Radić, Martina; Ćetković, Helena; Ačkar, Lucija; Herak Bosnar, Maja.
Structure, function and localization of NME6 ¬ a member of the NME/NDP kinase family. 45th FEBS Congress Abstracts; Virtualno, 2021. 025¬23, 1 (poster, sažetak, znanstveni)