Dipeptidil peptidaza III (DPP III) je cink-ovisna metalopeptidaza koja uzastopno odcjepljuje dipeptide s amino-kraja 3 do 10 aminokiselina dugih peptida te je široko rasprostranjena u organizmima od bakterija do ljudi. Smatra se da ima ulogu u završnim stadijima proteinskog metabolizma u stanici te u regulaciji krvnog tlaka i boli. DPP III je također uključena u regulaciju Nrf2/KEAP1 signalnog puta kroz kompetitivno vezanje na protein KEAP1 koje dovodi do oslobađanja transkripcijskog faktora Nrf2 i aktivacije odgovora na oksidativni stres. U potrazi za drugim proteinskim interaktorima DPP III, pomoću SILAC-MS metode, identificiran je protein SH2 domain-containing protein 3C (SH2D3C) kao potencijalni interaktor. Interakcija je potvrđena na prekomjerno eksprimiranim proteinima korištenjem nekoliko biokemijskih metoda. SH2D3C je jedan od tri člana proteinske NSP obitelji koji sadrže domenu SH2, RasGEF sličnu domenu te regiju bogatu prolinima i serinima između tih dviju domena. SH2D3C i ostala dva člana porodice (SH2D3A and BCAR3) djeluju kao adaptorski i konstrukcijski proteini koji kontroliraju migraciju stanica integriranjem prijenosa signala preko faktora rasta i integrina, ali precizni način njihovog djelovanja još uvijek je nepoznat. U predloženom istraživanju planiramo potvrditi interakciju na endogenim proteinima, utjecaj svakog od proteina na stanične procese u kojima sudjeluju prekomjernom ekspresijom proteina te izbacivanjem (engl. knock out) gena, odrediti afinitet vezanja pomoću biofizičkih metoda te predvidjeti mjesta vezanja molekulskim modeliranjem. Rezultati predloženog istraživanja omogućit će bolje razumijevanje uloge DPP III u signalnim putevima u koje je uključen SH2D3C i obratno. Imajući u vidu da su kontrola migracije stanica i signalni put Nrf2/KEAP1 često narušeni u raku, rezultati predloženog istraživanja mogli bi otvoriti nove mogućnosti za detekciju biomarkera i liječenje raka.

SUDJELOVANJE NA SKUPOVIMA:

Mihaela Matovina sudjelovala na 45^th FEBS Congress, 03.-08.07.2021. Virtualno/Ljubljana, Slovenija, postersko priopćenje

Ana Tomašić Paić, Lea Barbarić i Mihaela Matovina sudjelovale na Radionici iz Preparativne kromatografije ionske izmjene, 16.-17.12.2021., BioCentar, Zagreb.

Mihaela Matovina sudjelovala na konferenciji The 25th IUBMB Congress, the 46th FEBS Congress and the 15th PABMB Congress (The Biochemistry Global Summit), 9.-14.7.2022., Lisabon, Portugal, postersko priopćenje

Mihaela Matovina i Lea Barbarić sudjelovale na konferenciji International Congress of the Croatian Society of Biochemistry and Molecular Biology HDBMB22: FROM SCIENCE TO KNOWLEDGE, 28.09.-01.10.2022., Brela, Hrvatska, postersko priopćenje MM, postersko priopćenje LB

Lea Barbarić sudjelovala na EMBL radionici "Protein quality control in downstream processes", 29.11.-02.12.2022., Heidelberg, Njemačka. Radionica se sastojala od kratkih predavanja na temu proizvodnje i kontrole kvalitete proteina korištenjem biofizikalnih tehnika poput DSL-a, MST-a, ITC-a, SEC-MALS-a, nanoDSF-a, cryo-EM-a, i sl. Održani su i laboratorijski praktikumi u svrhu dobivanja praktičnog iskustva s navedenim tehnikama na vlastitim uzorcima.

Ana Tomašić Paić sudjelovala na 4th ISFMS—Biochemistry, Molecular Biology and Druggability of Proteins (ISFMS2022), 06.-09.09.2022., Firenca, Italija, postersko priopćenje

Marina Oskomić sudjelovala je na školi BenBedPhar Training School 2023 organiziranoj u sklopu COST akcije CA20121 „Bench to Bedside transition for Pharmacological regulation of NRF2 in non communicable diseases“, 26.-30.06.2023. u Dvorcu Smolenice, Slovačka, postersko priopćenje

Lea Barbarić i Marina Oskomić sudjelovale na ljetnoj školi MedILS School in Bioinformatics Part I (21.-25.08.2023.) i Part II (16.-20.10.2023.)  na Mediteranskom Institutu za istraživanje života (MedILS), Split, Hrvatska.

Mihaela Matovina sudjelovala je na sastanku u sklopu COST akcije CA20121 „Bench to Bedside transition for Pharmacological regulation of NRF2 in non communicable diseases“, 12.-13.10.2023. u Grazu, Austrija s predavanjem „The effect of DPP3 mutation found in cancer on the KEAP1-NRF2 Signaling Pathway“, predavanje

OBJAVLJENI RADOVI:

M. Matovina i sur. Identification of SH2 Domain-Containing Protein 3C as a Novel, Putative Interactor of Dipeptidyl Peptidase 3, Int. J. Mol. Sci. 2023, 24(18), 14178; https://doi.org/10.3390/ijms241814178

SURADNICI:

Koraljka Husnjak

Tea Pavkov-Keller