Zaklada HAZU dodijelila potporu projektu CIR-ovom novaku Ivanu Soviću
Odlukom Upravnog odbora Zaklade Hrvatske akademije znanosti i umjetnosti od 08.09.2015. odobrena je financijska potpora projektu "Metode poravnanja i sastavljanja DNA sekvenci dobivenih sekvenciranjem nanoporama" u iznosu 5000kn. Predlagatelj projekta, Ivan Sović, znanstveni je novak u Centru za informatiku i računarstvo, a projekt je usko vezan uz temu njegovog doktorskog rada.
Glavni cilj projekta razviti je učinkovite algoritme za poravnanje i sastavljanje sekvenci koji brzo i s velikom točnošću mogu rukovati podatcima treće generacije. Treća generacija sekvencera naročito je zanimljiva zbog najnovije tehnologije kompanije Oxford Nanopore čiji uređaji su prilično malih dimenzija (veličine mobitela; uređaji konkurencije teže i do 1000kg; spaja se na USB 3.0 sučelje), cijene i do nekoliko redova veličine manje od konkurencije, te omogućuju dobivanje velikih količina podataka, no uz vrlo veliku pogrešku. Postojeće metode nisu dovoljno osjetljive za uspješno rukovanje vrlo dugačkim očitanjima (~10000bp i više) s tom razinom pogreške (~30%) koja se dobiju kao rezultat sekvenciranja. Kao preliminarni rezultat, u sklopu ovog projekta razvijena je nova, vrlo točna i osjetljiva metoda za poravnanje sekvenci pod nazivom "GraphMap": http://biorxiv.org/content/early/2015/06/10/020719. Metoda je implementirana i javno dostupna pod MIT licencom: https://github.com/isovic/graphmap.git.