Prijeđite na glavni sadržaj

Alternativni putevi rekombinacije i popravka DNA kod bakterija Escherichia coli i Deinococcus radiodurans

Kategorija
Projekti Hrvatske zaklade za znanost
Datum početka
28.12.2023.
Datum završetka
27.12.2027.
Status
Aktivan

Glavni istraživač

Homologna rekombinacija (HR) je esencijalan biološki proces koji sudjeluje u popravku oštećenja molekule DNA i u očuvanju integriteta genoma. U bakteriji Escherichia coli, razlikuju se dva glavna puta homologne rekombinacije, RecBCD i RecFOR, koji koriste različite enzime za obradu krajeva DNA i vezanje rekombinaze RecA. U radiorezistentnoj bakteriji Deinococcus radiodurans, glavnina dvolančanih lomova DNA popravlja se pomoću dva HR procesa koja ovise o proteinu RecA – ESDSA i klasična homologna rekombinacija. Naša grupa je nedavno identificirala dva alternativna rekombinacijska puta: (i) RecBCD- RecFOR-neovisni (RecBFI) put rekombinacije koji djeluje u mutantima sbcB15 sbcCD bakterije E. coli, u kojem mutirani protein SbcB15 posreduje u sklapanju RecA filamenta i (ii) alternativno spajanje krajeva DNA (A-EJ), proces koji omogućava značajan, ali neprecizan RecA-neovisan popravak dvolančanih lomova DNA i koji rezultira velikim genomskim rearanžmanima kod bakterije D. radiodurans. U sklopu ovog projekta identificirat ćemo nove gene/proteine i uvjete koji potiču RecBFI rekombinaciju u bakteriji E. coli te A-EJ rekombinaciju (i posljedične genomske rearanžmane) u bakteriji D. radiodurans. U istraživanjima ćemo koristiti sekvenciranje nove generacije i napredne bioinformatičke alate (i) za identifikaciju supresorskih mutacija koje aktiviraju RecBFI rekombinaciju kod bakterije E. coli i (ii) za identifikaciju genomskih rearanžmana kod bakterije D. radiodurans. Kombiniranjem genetičkih, molekularno-bioloških i mikroskopskih metoda istražit ćemo učinak različitih mutacija od interesa na rast, vijabilnost i kapacitet bakterijskih stanica za popravak DNA te na morfologiju i segregaciju bakterijskih kromosoma. S obzirom da je homologna rekombinacija evolucijski vrlo sačuvan proces, rezultati naših istraživanja na bakterijama su relevantni za istraživanja karcinoma i drugih bolesti kod ljudi koje su povezane s defektima u rekombinaciji DNA i genomskim rearanžmanima.

Zavod za molekularnu biologiju

Ova stranica koristi kolačiće. Neki od tih kolačića nužni su za ispravno funkcioniranje stranice, dok se drugi koriste za praćenje korištenja stranice radi poboljšanja korisničkog iskustva. Za više informacija pogledajte naše uvjete korištenja.

Prilagodi postavke
  • Kolačići koji su nužni za ispravno funkcioniranje stranice. Moguće ih je onemogućiti u postavkama preglednika.